八十八佛是五十三佛加三十五佛。五十三佛名见《观药王药上二菩萨经》，是娑婆世界的过去佛；三十五佛名出《决定毗尼经》，是十方世界的佛。这八十八佛都可以为众生作忏悔主，因此，人们可以向他们申述自己改悔过恶的愿望。法古时规定，念《大忏悔文》须行一百零八礼，现代则多跪诵而不礼拜了。
“尔时药上菩萨，说是过去五十三佛名已，默然而住。尔时，行者即于定中，得见过去七佛世尊毗婆尸佛，而赞叹言：‘善哉!善哉!善男子，汝所宣说五十三佛。乃是过去久远旧住娑婆世界。成熟众生而般涅盘。若有善男子善女人及余一切众生。得闻是五十三佛名者。是人于百千万亿阿僧祇劫不堕恶道。若复有人能称是五十三佛名者。生生之处常得值遇十方诸佛。若复有人能至心敬礼五十三佛者。除灭四重五逆及谤方等皆悉清净。以是诸佛本誓愿故。于念念中即得除灭如上诸罪。尸弃如来。毗舍浮如来。拘留孙如来。拘那含牟尼如来。迦叶如来。亦赞是五十三佛名。亦复赞叹善男子善女人。能闻是五十三佛名者。能称名者能敬礼者。除灭罪障如上所说。”三十五佛出《决定毗尼经》，是十方世界的佛。
三十五佛
“若有菩萨，成就五无间罪，犯于女人，或犯男子，或故犯塔犯僧，如是等余犯菩萨，应于三十五佛边，所犯重罪，昼夜独处，至心忏悔。忏悔法者，归依佛，归依法，归依僧。
南无释迦牟尼佛 南无金刚不坏佛 南无宝光佛 南无龙尊王佛 南无精进军佛南无精进喜佛 南无宝火佛 南无宝月光佛 南无现无愚佛 南无宝月佛 南无无垢佛 南无离垢佛 南无勇施佛 南无清净佛 南无清净施佛 南无娑留那佛 南无水天佛 南无坚德佛 南无栴檀功德佛 南无无量掬光佛 南无光德佛 南无无忧德佛 南无那罗延佛 南无功德华佛 南无莲华光游戏神通佛 南无财功德佛 南无德念佛 南无善名称功德如来 南无红炎幢王如来 南无善游步功德如来 南无斗战胜如来 南无善游步如来 南无周匝庄严功德如来 南无宝华游步如来 南无宝莲华善住娑罗树王如来
众罪皆忏悔， 诸福尽随喜， 及请佛功德， 愿成无上智， 去来现世佛， 于众生最胜， 无量功德海， 归依合掌礼。
如是舍利弗。菩萨如是观此三十五佛，如在，思惟如来所有功德，应作如是清净忏悔，菩萨若能净此罪已，尔时诸佛为其现身。”
《宝积经》云：“一切众生，若有身具五逆十恶重罪之者，万劫千生不通忏悔，应须顶礼三十五佛，至心忏悔，一切罪障，皆得除灭。”
由此可见，称念礼拜八十八佛，功德威神不可思议，能除一切极恶重罪。是故我等末世行人，不论罪障迷惑，若轻若重，悉应至诚，恭敬礼拜八十八佛功德名号。亦如过现未来三千诸佛，早得成佛。
取相忏中（对着88佛像），至诚礼拜八十八佛，最为殊胜，最为简便，亦最常用，极易感应，得见瑞相，身心轻安，足以证明，罪灭障除，堪可进功，修行办道。是故古德大善知识，将之列入早晚课诵。
五十三佛
从“ 南无普光佛”到“南无一切法常满王佛”为五十三佛，出自《佛说观药王药上二菩萨经》。药上菩萨宣说了佛名，过去七佛于经中言：“善哉善哉，善男子，汝所宣说五十三佛，乃是过去久远旧住娑婆世界，成熟众生而般涅盘。若有善男子，善女人，及余一切众生，得闻是五十三佛名者，是人于百千万亿阿僧祇劫，不堕恶道。若复有人，能称是五十三佛名者，生生之处，常得值遇十方诸佛。若复有人，能至心敬礼五十三佛者，除灭四重五逆及谤方等（经典），皆悉清净。以是诸佛本誓愿故，于念念中，即得除灭如上诸罪。尸弃如来、毗舍浮如来、拘留孙如来、拘那含牟尼如来、迦叶如来，亦赞是五十三佛名，亦复赞叹，善男子，善女人，能闻是五十三佛名者，能称名者，能敬礼者，除灭罪障，如上所说。”
本师释迦牟尼佛，因众多因缘而化现于世，而本师所以与贤劫千佛出兴于世，与往昔末法闻是五十三佛名大有关系，所以在本经中亦作是言：
“尔时，释迦牟尼佛，告大众言：我曾往昔，无数劫时，于妙光佛末法之中，出家学道，闻是五十三佛名，闻已合掌，心生欢喜，复教他人，令得闻持，他人闻已，展转相教，乃至三千人，此三千人，异口同音，称诸佛名，一心敬礼，以是敬礼诸佛因缘功德力故，即得超越无数亿劫生死之罪。其千人者，花光佛为首，下至毗舍浮佛，于庄严劫，得成为佛，过去千佛是也。此中千佛者，拘留孙佛为首，下至楼至如来，于贤劫中次第成佛。后千佛者，日光如来为首，下至须弥相，于星宿劫中当得成佛。佛告宝积，十方现在诸佛，善德如来等，亦曾得闻是五十三佛名故，于十方面各皆成佛。”